Die Mittel der am Markt aufgenommenen Anleihen werden als Darlehen an die 24 schweizerischen Kantonalbanken weitergegeben. Die Kantonalbanken halten nicht nur das gesamte Aktienkapital der Pfandbriefzentrale, sondern sind auch die einzigen Darlehensnehmer. Für 21 Kantonalbanken besteht eine unbeschränkte Staatsgarantie ihres Kantons. Alle Kantonalbanken verfügen über eine gute bis sehr gute Bonität.

Die als Deckung dienenden Hypothekardarlehen der Mitgliedbanken unterliegen strengen gesetzlichen und reglementarischen Vorschriften. Diese beschränken die Belehnung auf maximal zwei Drittel des Belehnungswertes der Liegenschaften. Alle als Pfandobjekte dienenden Liegenschaften befinden sich in der Schweiz. Für die von den Kantonalbanken bezogenen Darlehen müssen Pfandobjekte im Umfang von 115 % des Darlehensbetrages als Sicherheit verpfändet werden. Der Zinsertrag der für die Pfandbriefdarlehen ausgeschiedenen Hypotheken muss mindestens 10 % höher sein als der Zinsaufwand für die bezogenen Pfandbriefdarlehen. Mit der gesetzlichen Verpflichtung, diese Kriterien jederzeit einzuhalten, ist bei Bedarf der Austausch von nicht mehr genügenden Sicherheiten gewährleistet. Der Verwaltungsrat der Pfandbriefzentrale hat die Darlehensbezüge für die Mitgliedbanken auf 35 % ihrer bilanzierten inländischen Hypothekarforderungen beschränkt.